More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2753 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  594  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  50.66 
 
 
310 aa  288  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  50.99 
 
 
326 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
314 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  51.99 
 
 
314 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
307 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  50.79 
 
 
322 aa  275  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
305 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  47.84 
 
 
312 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  47.68 
 
 
315 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  47.7 
 
 
304 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
309 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 
316 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  47.85 
 
 
320 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  46.64 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  44.11 
 
 
310 aa  242  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  43.56 
 
 
309 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.14 
 
 
305 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.86 
 
 
305 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.96 
 
 
308 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
308 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
307 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
306 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.25 
 
 
317 aa  188  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  59.87 
 
 
163 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  39.13 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.1 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  47.44 
 
 
162 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.61 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
161 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  35.76 
 
 
161 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
161 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
326 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
143 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  28.24 
 
 
313 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
325 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
321 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
326 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
326 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
326 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
329 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.31 
 
 
325 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.24 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
336 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 
166 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.91 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
337 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.76 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  28.01 
 
 
290 aa  85.9  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  31.88 
 
 
848 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.28 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  27.69 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  34.06 
 
 
162 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  24.82 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  21.97 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
168 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  34.81 
 
 
162 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
347 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.21 
 
 
349 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
340 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
168 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
175 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  22.18 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  35.34 
 
 
162 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  30.56 
 
 
161 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
189 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  30.88 
 
 
160 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
196 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 
347 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  36.45 
 
 
162 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  33.62 
 
 
162 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
161 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
167 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
212 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
167 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  20.49 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 
168 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
166 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
166 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 
183 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
154 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
171 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
171 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
167 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 
157 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>