More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03639 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  93.99 
 
 
301 aa  523  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  55.48 
 
 
322 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  53.36 
 
 
313 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  55.83 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  53.36 
 
 
320 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  52.86 
 
 
349 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  52.86 
 
 
347 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  52.5 
 
 
349 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
352 aa  299  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  52.3 
 
 
334 aa  299  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  52.65 
 
 
340 aa  296  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  53 
 
 
309 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
347 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  53 
 
 
340 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  53 
 
 
326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
307 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  62.66 
 
 
167 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  61.39 
 
 
167 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  60.13 
 
 
177 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  58.97 
 
 
167 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  59.49 
 
 
167 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  59.49 
 
 
167 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  59.49 
 
 
167 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  58.6 
 
 
170 aa  198  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  63.69 
 
 
167 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  63.69 
 
 
167 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  63.69 
 
 
167 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  63.69 
 
 
167 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  63.69 
 
 
167 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  56.69 
 
 
167 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  55.41 
 
 
167 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  60.76 
 
 
172 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  63.29 
 
 
167 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  57.32 
 
 
173 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  62.66 
 
 
167 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  62.66 
 
 
167 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  63.29 
 
 
167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  63.29 
 
 
167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  63.29 
 
 
167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  59.62 
 
 
167 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 
161 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  41.29 
 
 
161 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  43.95 
 
 
163 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  40.88 
 
 
160 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  37.5 
 
 
164 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
161 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  39.24 
 
 
162 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  36.25 
 
 
157 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
159 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
159 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  27.56 
 
 
319 aa  89.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  27.17 
 
 
319 aa  89  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  35.85 
 
 
164 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.45 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
161 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
160 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
169 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.38 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  24.33 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.95 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.15 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.9 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.14 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.34 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.59 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  24.92 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  25.09 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  23.37 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  33.33 
 
 
148 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 
150 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
148 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.44 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  24.69 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  30.17 
 
 
151 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  30.17 
 
 
151 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 
160 aa  62.4  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  25.65 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
164 aa  62.4  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.68 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.25 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.05 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>