More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0893 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  98.65 
 
 
148 aa  296  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
322 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
352 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.69 
 
 
325 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  30.09 
 
 
313 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
301 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  35.11 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
158 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
178 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
162 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  32.58 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1670  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000203174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  34.78 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  27.27 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  32.18 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  29.11 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0782  putative helix-turn-helix transcriptional regulator  32.35 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
303 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 
220 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 
168 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
163 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
176 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  27.47 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
169 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 
168 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  35.06 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  32.71 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  30.67 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>