More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3535 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
164 aa  327  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  69.51 
 
 
169 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  65.61 
 
 
163 aa  204  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  64.33 
 
 
162 aa  203  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  61.78 
 
 
162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  62.42 
 
 
162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  59.24 
 
 
171 aa  188  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  59.49 
 
 
189 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  58.6 
 
 
171 aa  188  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  59.35 
 
 
196 aa  183  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  55.37 
 
 
195 aa  177  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  54.9 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  52.15 
 
 
162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  51.68 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  56.62 
 
 
163 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  51.63 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  46.05 
 
 
175 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  46.71 
 
 
166 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  46.71 
 
 
166 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  48.3 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  46.05 
 
 
154 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  43.4 
 
 
387 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  43.75 
 
 
238 aa  118  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  47.3 
 
 
380 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  40.82 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2929  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
161 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0333345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  38.52 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.971308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  34.06 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  34.06 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.59 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  38.98 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  32.41 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  32.41 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  34.97 
 
 
312 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  32.08 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  38.1 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 
301 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  31.43 
 
 
283 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  35.07 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873897  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  36.89 
 
 
163 aa  61.2  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  35.34 
 
 
160 aa  60.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
174 aa  60.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1699  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
183 aa  60.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  30.94 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  30.94 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  30.94 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  30.94 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  30.94 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3907  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.215987 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1365  putative acetyltransferase  36.7 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5878  GCN5-related N-acetyltransferase  37.27 
 
 
188 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703036  normal  0.0941301 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  39.6 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658468  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0377  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294177  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3939  GCN5-related N-acetyltransferase  37.27 
 
 
188 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4427  GCN5-related N-acetyltransferase  37.27 
 
 
188 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
340 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
307 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  32.61 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  32.61 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1535  GCN5-related N-acetyltransferase  36.43 
 
 
188 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0387  putative acetyltransferase  35.64 
 
 
182 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47745  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  32.61 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5200  acetyltransferase  31.34 
 
 
180 aa  57.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5563  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
183 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
155 aa  57.4  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3859  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
188 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
352 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0403  putative acetyltransferase  32.31 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.03 
 
 
322 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4319  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
347 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  27.05 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
320 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5914  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
291 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0291  acetyltransferase  33.67 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0338432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1922  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.45 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641628  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  35.96 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2930  acetyltransferase  34.29 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  0.361463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>