254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3682 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
167 aa  343  8e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  99.4 
 
 
167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  98.8 
 
 
167 aa  338  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  85.63 
 
 
177 aa  293  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  74.85 
 
 
167 aa  260  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  73.65 
 
 
167 aa  257  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  71.86 
 
 
167 aa  253  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  66.47 
 
 
167 aa  238  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  66.47 
 
 
167 aa  237  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  71.26 
 
 
167 aa  227  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  68.26 
 
 
167 aa  222  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  68.26 
 
 
167 aa  222  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  68.26 
 
 
167 aa  222  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  68.26 
 
 
167 aa  222  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  68.26 
 
 
167 aa  222  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  65.87 
 
 
167 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  65.87 
 
 
167 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  65.87 
 
 
167 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  65.87 
 
 
167 aa  213  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  65.87 
 
 
167 aa  213  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  65.87 
 
 
167 aa  213  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  69.05 
 
 
172 aa  213  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  64.33 
 
 
312 aa  207  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  62.42 
 
 
313 aa  204  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  60.65 
 
 
320 aa  201  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  59.87 
 
 
322 aa  200  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  61.04 
 
 
347 aa  200  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  59.49 
 
 
283 aa  200  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  60.39 
 
 
349 aa  198  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  60.39 
 
 
349 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  59.87 
 
 
301 aa  197  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  61.39 
 
 
340 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  57.32 
 
 
334 aa  186  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  61.69 
 
 
347 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  53.37 
 
 
352 aa  184  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  58.23 
 
 
309 aa  175  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  53.16 
 
 
173 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  60.13 
 
 
340 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  60.13 
 
 
326 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  51.61 
 
 
170 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  50.33 
 
 
326 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
307 aa  151  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  43.04 
 
 
161 aa  141  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  43.21 
 
 
161 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  42.04 
 
 
163 aa  132  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  41.4 
 
 
161 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  40.65 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  35.22 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  38.12 
 
 
162 aa  105  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  35.19 
 
 
157 aa  94.4  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  33.09 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
152 aa  61.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
196 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1922  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.89 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641628  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  30.34 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  34.31 
 
 
387 aa  55.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  31.25 
 
 
153 aa  55.1  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 
162 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
171 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  40.28 
 
 
184 aa  54.3  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.39 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
309 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0387  putative acetyltransferase  29.09 
 
 
182 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47745  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.37 
 
 
304 aa  51.2  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0578  acetyltransferase-like  32.41 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0334685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  30.65 
 
 
319 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.98 
 
 
319 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  40.7 
 
 
212 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  32.52 
 
 
290 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  29.84 
 
 
319 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  40.24 
 
 
380 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  52.08 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2081  GNAT family acetyltransferase  37.08 
 
 
156 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
188 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658468  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>