182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6080 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  100 
 
 
319 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  63.92 
 
 
345 aa  434  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  58.86 
 
 
316 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  50.31 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.74 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  59.48 
 
 
160 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  44.91 
 
 
168 aa  148  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  30.35 
 
 
324 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
327 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09031  transcriptional regulator, MarR family protein  42.67 
 
 
151 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
166 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
310 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  36.31 
 
 
184 aa  99.4  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
161 aa  95.5  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
156 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  24.92 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.48 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  24.92 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  24.92 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
347 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
349 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.33 
 
 
349 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.96 
 
 
294 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.54 
 
 
326 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  23.6 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  23.93 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  23.69 
 
 
352 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  23.35 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  23.6 
 
 
309 aa  55.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
172 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  25.51 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
160 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  22.45 
 
 
283 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  23.1 
 
 
347 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
161 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
169 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  34.31 
 
 
159 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
159 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
159 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
168 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  44.07 
 
 
167 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  44.07 
 
 
167 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
162 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  44.07 
 
 
167 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  38.03 
 
 
167 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  38.03 
 
 
167 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  25.88 
 
 
170 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  38.03 
 
 
167 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  38.03 
 
 
167 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  38.03 
 
 
167 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  28.57 
 
 
161 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.96 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  22.14 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4527  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
165 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
381 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
167 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
151 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  22.42 
 
 
164 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
143 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  37.29 
 
 
166 aa  49.3  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
167 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  40.68 
 
 
167 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  40.98 
 
 
167 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  44.07 
 
 
167 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
167 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0125  hypothetical protein  34.44 
 
 
154 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  23.02 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  44.07 
 
 
167 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
162 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
160 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  40.68 
 
 
167 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  40.68 
 
 
167 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  40.98 
 
 
167 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4565  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  20.91 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.44 
 
 
152 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
161 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
164 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.156182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
158 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0433  acetyltransferase  37.14 
 
 
165 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0022  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
164 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.545701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.71 
 
 
153 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  30.39 
 
 
324 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
168 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
162 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34630  acetyltransferase  37.04 
 
 
212 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
144 aa  46.6  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
167 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
161 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
161 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  32.14 
 
 
160 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>