128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4590 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  320  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  67.11 
 
 		 161 aa  220  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  57.79 
 
 		 314 aa  194  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 		 316 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.7 
 
 		 318 aa  104  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.69 
 
 		 319 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.03 
 
 		 338 aa  91.3  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 345 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 		 327 aa  74.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 323 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 324 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  19.74 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  23.74 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3540  regulatory protein MarR  23.78 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.074778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4527  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  27.12 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6449  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  26.13 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  28.67 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0090  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  26.45 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  34.72 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 182 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  25.86 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  28.16 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  28.74 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 162 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  26.58 
 
 		 159 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 144 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 144 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 144 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 144 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>