More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1273 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
168 aa  339  9e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  71.43 
 
 
173 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  66.46 
 
 
181 aa  225  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  63.58 
 
 
177 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  62.11 
 
 
177 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  60 
 
 
162 aa  191  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  58.79 
 
 
174 aa  184  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  55.83 
 
 
167 aa  181  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  55 
 
 
170 aa  175  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  57.86 
 
 
178 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  53.12 
 
 
166 aa  167  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  53.66 
 
 
207 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
168 aa  157  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  50.61 
 
 
167 aa  157  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  50.31 
 
 
170 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
173 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
180 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  52.35 
 
 
166 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
165 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  52.2 
 
 
167 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  51.88 
 
 
185 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  51.88 
 
 
185 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 
179 aa  148  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  50.31 
 
 
165 aa  147  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  50.61 
 
 
185 aa  147  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
147 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
177 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 
189 aa  61.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
171 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
176 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
176 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
176 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
138 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
205 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
148 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 
178 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
153 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
148 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
138 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 
164 aa  57.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  46.91 
 
 
164 aa  58.2  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
157 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
138 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
138 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  30.06 
 
 
180 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
148 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  43.94 
 
 
151 aa  57.4  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
152 aa  57.4  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  30.95 
 
 
150 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  47.14 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  30.37 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  38.57 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  34.39 
 
 
194 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>