114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4054 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  631  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.12 
 
 		 316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.82 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  47.1 
 
 		 162 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.22 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.87 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09031  transcriptional regulator, MarR family protein  39.07 
 
 		 151 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  41.55 
 
 		 166 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  40.58 
 
 		 184 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 		 160 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 		 168 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  25.32 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 161 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.68 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 161 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  29.05 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 141 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  28.69 
 
 		 161 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 188 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 146 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 164 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3540  regulatory protein MarR  33.97 
 
 		 154 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.074778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 169 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.22 
 
 		 283 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 161 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 347 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6449  transcriptional regulator, MarR family  29.53 
 
 		 159 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.81 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 		 152 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 		 161 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 151 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 		 169 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.8 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1670  putative acetyltransferase  36.78 
 
 		 156 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 165 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 		 166 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 161 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 183 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 174 aa  46.2  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 173 aa  45.8  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 143 aa  45.8  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1928  GCN5-related N-acetyltransferase  28.04 
 
 		 154 aa  45.8  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 185 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 167 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 143 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  32.04 
 
 		 164 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 152 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 163 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 157 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 136 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  29.81 
 
 		 139 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 149 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 149 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 136 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 149 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 149 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 149 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 187 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 168 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.68 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 149 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 161 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 164 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.51 
 
 		 147 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  22.18 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2006  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 		 166 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.88 
 
 		 147 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 142 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 146 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  26.01 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>