More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0942 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  330  4e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  48.87 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  48.87 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 147 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 149 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 148 aa  99  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 148 aa  99  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  42.06 
 
 		 141 aa  86.3  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.85 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  38.66 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  35.88 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  40.46 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  38.83 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  37.1 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  40 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  42.71 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  31.69 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  37.19 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3588  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  34.81 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  39.5 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  36.36 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>