More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3239 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 160 aa  327  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  27.14 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  27.21 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  22.06 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  28.06 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.19 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  25.34 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 169 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  25 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  25.23 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  25.23 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  37.5 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  23.76 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  21.32 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  23.19 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 170 aa  47.8  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 324 aa  47.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  26.32 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>