221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3047 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  320  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 174 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  61.07 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  58.82 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 162 aa  166  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  51.32 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  49.68 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 680 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  38.75 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  37.31 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  29.91 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  33.59 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  25.52 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  41.33 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  30.48 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  31.07 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  33.72 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  34.18 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  26.74 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  30 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0090  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 321 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  44.9 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  31.91 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 325 aa  44.3  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 336 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  43.9  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.84 
 
 		 316 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>