More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0305 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  49.14 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  42.76 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  42.06 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  39.42 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  41 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  44.71 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  33.88 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  36.36 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  34.95 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  32.48 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  52  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 147 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 147 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 166 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  28.49 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0281  regulatory protein MarR  32.99 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>