89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1861 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  92.86 
 
 		 157 aa  286  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  77.42 
 
 		 165 aa  248  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  72.61 
 
 		 161 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  63.69 
 
 		 162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  63.69 
 
 		 162 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  63.69 
 
 		 162 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  63.06 
 
 		 162 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 161 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  29.91 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  32.98 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.6 
 
 		 316 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  39.39 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.61 
 
 		 155 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  31.36 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 146 aa  47.8  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  28.3 
 
 		 132 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 154 aa  44.3  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  25.61 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  37.31 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 261 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  30.09 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  23.13 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  28.41 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 156 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  27.91 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  29.35 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 323 aa  41.2  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 153 aa  41.2  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  29.41 
 
 		 170 aa  41.2  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  24.18 
 
 		 327 aa  40.8  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 142 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 150 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  26.14 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>