143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0090 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0090  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  38.04 
 
 		 170 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  39.24 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0119  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 178 aa  94.7  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4672  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4831  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0441993 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0948  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3566  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.960131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3286  transcriptional regulator, MarR family  31.35 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000146824  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 296 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.65 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 158 aa  51.6  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  31.78 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 171 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  30.93 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  30.93 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  45.16 
 
 		 163 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  30.93 
 
 		 157 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 155 aa  47.8  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  32.97 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 325 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  34 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.49 
 
 		 141 aa  45.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 160 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  29.03 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 156 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 155 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 167 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 171 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  31.48 
 
 		 173 aa  44.7  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  34.58 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.98 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.88 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  28.16 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  27.66 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  29.59 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 321 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>