More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1679 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 141 aa  276  9e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  41.55 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  31.62 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  45.08 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  25.19 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  39.44 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  29.69 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  31.78 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  31.78 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  31.78 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  31.78 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  28.95 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  31.48 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>