More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0696 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 143 aa  287  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 199 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 193 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  45.74 
 
 		 186 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0927  transcriptional regulator, MarR family  44.63 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 303 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  38.83 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  41.12 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  38.1 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  36.54 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.37 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  36.73 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  35.16 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  42.71 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  28.91 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  33.94 
 
 		 292 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.7 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  36.84 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  28.15 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  33.65 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  26.06 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  34.74 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  28.91 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  29.37 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  28.12 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>