More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5092 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  327  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  41.86 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  39.23 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 154 aa  94.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  38.17 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  34.38 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  32.06 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  33.08 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  39.09 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 303 aa  64.3  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.29 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  47.06 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  34.06 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  25.81 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  37.17 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  46.27 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  46.27 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 325 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.9 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>