More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3234 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 154 aa  306  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  52.59 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  51 
 
 		 146 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  42.17 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  32.67 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  34.4 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  39.77 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  40.66 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  32 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  40.66 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32.14 
 
 		 178 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  41.57 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  29.29 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  35.71 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  46.58 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>