More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0325 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 152 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.86 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  28.08 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 181 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  34.55 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 296 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  29.91 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  30.85 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.43 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>