More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02009 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  87.3 
 
 		 194 aa  330  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  87.3 
 
 		 194 aa  330  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  76.97 
 
 		 203 aa  260  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 162 aa  193  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  60.25 
 
 		 175 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 186 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  50.29 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 168 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 162 aa  168  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 158 aa  165  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 161 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  53.02 
 
 		 158 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 163 aa  150  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 161 aa  141  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 		 186 aa  121  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 157 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 145 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 167 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 164 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 158 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 137 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  43.18 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  38.95 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  41.23 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.89 
 
 		 157 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.89 
 
 		 157 aa  62  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 142 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  34.26 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  39.32 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  29.93 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  32.77 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  45.59 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  40.79 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  32.43 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>