More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3125 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 157 aa  308  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  100 
 
 		 157 aa  306  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  89.17 
 
 		 157 aa  275  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  74.83 
 
 		 158 aa  203  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  70.97 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 167 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 		 173 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  40.22 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  33.06 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  43 
 
 		 303 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4869  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  43.04 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5199  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.67 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0059  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0308587  hitchhiker  0.00000975355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  37.89 
 
 		 201 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  33.08 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4909  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4773  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5185  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  34.53 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  27.01 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.69 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>