More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7166 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  96.26 
 
 		 186 aa  366  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  86.34 
 
 		 185 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  63.09 
 
 		 162 aa  198  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 168 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 167 aa  190  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 162 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  47.19 
 
 		 194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  47.19 
 
 		 194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  50.29 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 158 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 161 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  57.72 
 
 		 158 aa  175  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  54 
 
 		 175 aa  174  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 163 aa  165  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 		 186 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 145 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 158 aa  104  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  38.46 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  38.1 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  39.66 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  35.04 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  35.59 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  31.53 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  38.52 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  33.88 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 154 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 167 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  29.51 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  40.45 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.37 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>