More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0630 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  56.8 
 
 
149 aa  151  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  43.86 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
173 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
177 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.46 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  27.01 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  39.56 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
152 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  39.33 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
152 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
152 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
152 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 
152 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
152 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
154 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  42.67 
 
 
146 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
187 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
186 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  30.84 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  25.19 
 
 
153 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  22.31 
 
 
149 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
147 aa  58.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  32.04 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
188 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
141 aa  57  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  30.43 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  33.91 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
160 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
169 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  30.97 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
172 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  25.58 
 
 
176 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  29.91 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>