More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1579 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  358  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  74.32 
 
 		 155 aa  229  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  76.39 
 
 		 156 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.63 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.51 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  38.3 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  38.89 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  30.97 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  30.97 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  31.93 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  30.08 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  32 
 
 		 292 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  33.68 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.3 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  33.68 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 171 aa  50.8  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 141 aa  51.2  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4869  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 136 aa  50.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>