More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0592 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 158 aa  267  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  81.7 
 
 		 158 aa  263  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  73.86 
 
 		 163 aa  232  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 168 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 167 aa  181  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  59.73 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 186 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  49.69 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 203 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  48.75 
 
 		 194 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  48.75 
 
 		 194 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  50.34 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  45.77 
 
 		 186 aa  133  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 204 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  34.06 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  30.14 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  34.09 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  31.85 
 
 		 175 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  37.3 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  34 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 191 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  30.66 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  31.58 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  32.14 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  30.91 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  34.55 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  39.39 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  45.07 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  33.06 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>