More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2113 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
162 aa  330  4e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  61.29 
 
 
167 aa  205  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  63.09 
 
 
168 aa  205  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  63.76 
 
 
186 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  63.09 
 
 
187 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  60.53 
 
 
201 aa  193  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  60.54 
 
 
162 aa  191  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  62.16 
 
 
161 aa  189  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  61.33 
 
 
158 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  59.21 
 
 
194 aa  187  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  59.21 
 
 
194 aa  187  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  58.44 
 
 
158 aa  184  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  54.84 
 
 
163 aa  170  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  56.08 
 
 
203 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  51.02 
 
 
175 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  46.54 
 
 
186 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  46.98 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  45.58 
 
 
157 aa  123  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  48.33 
 
 
161 aa  120  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
145 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.83 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.39 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.27 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  32.12 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  34.39 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
173 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  42.99 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  34.53 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  37.38 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  36.52 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  33.1 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 
162 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  35.48 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 
159 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
189 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 
138 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7540  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
158 aa  60.8  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 
172 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  35.85 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>