More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3618 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 167 aa  332  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 176 aa  194  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  54.04 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 169 aa  174  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  52.48 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  31.17 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  27.7 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  37.96 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  35.82 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.98 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.08 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  27.66 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.79 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  33.93 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  27.66 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.28 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  27.01 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  30.77 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  29.6 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  34.09 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>