More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0628 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  100 
 
 		 157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  44.14 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  36.96 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  39.45 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  32.09 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  35.65 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.08 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.08 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  27.61 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  28.24 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  34.38 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.24 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.24 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  29.69 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  29.69 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.24 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  29.69 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  29.69 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  33.04 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 179 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 177 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.64 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  38.78 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.91 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.91 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1408  regulatory protein MarR  30 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.247381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.02 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  33.63 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  33.63 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>