More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1076 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
168 aa  332  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  60.26 
 
 
173 aa  187  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  50.7 
 
 
154 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  46.98 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 
180 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
181 aa  94.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
172 aa  94.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
157 aa  94.4  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
160 aa  93.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  35.56 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
158 aa  90.9  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
165 aa  90.5  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
165 aa  90.5  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
158 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
160 aa  87.8  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  38.35 
 
 
158 aa  85.1  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  35.51 
 
 
162 aa  84.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2164  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  30.37 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  34.71 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  23.53 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  32.79 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  31.34 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.59 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  28.77 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  31.97 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  24.46 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  36.36 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
180 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1154  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  24.83 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
155 aa  61.6  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
164 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
157 aa  61.2  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 
151 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
164 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
152 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  38.82 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  28.91 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>