More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2639 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
150 aa  305  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0817  transcriptional regulator, MarR family  63.76 
 
 
150 aa  185  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  34.45 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
145 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
411 aa  58.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
172 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 
171 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 
177 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
173 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  31.87 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  28.97 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
171 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>