More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1844 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  44.8 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  43.2 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  43.65 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  43.65 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  43.65 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  38.79 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  38.79 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  43.16 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 192 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  31.11 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.15 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  23.91 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 173 aa  60.1  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  29.59 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  24.79 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  31.3 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5185  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  33.68 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.93 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  24.37 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  27.27 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>