More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4230 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  290  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  93.55 
 
 		 155 aa  288  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  90.97 
 
 		 155 aa  285  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  93.15 
 
 		 146 aa  275  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  92.36 
 
 		 148 aa  268  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  82.64 
 
 		 145 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  82.64 
 
 		 145 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  82.64 
 
 		 145 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  82.64 
 
 		 145 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  82.64 
 
 		 145 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  81.94 
 
 		 145 aa  239  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  81.94 
 
 		 145 aa  239  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  50 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  46.48 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  46.48 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  50.7 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  44.2 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  44.2 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  44.2 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  44.2 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  44.6 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  44.6 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  41.91 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  46.61 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  46.61 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  46.61 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  46.61 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  46.61 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  41.91 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.69 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 184 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 179 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  37.21 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  37.6 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 166 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  34.52 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  28.83 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  36.19 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  26.5 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  37.65 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  23.53 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>