265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2942 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  335  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  70 
 
 		 164 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  65.47 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 178 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  62.32 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  50 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  46.51 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  45.31 
 
 		 154 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  44.53 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  44.19 
 
 		 144 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 154 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  41.98 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 140 aa  99  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 140 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  41.98 
 
 		 140 aa  94.4  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  41.53 
 
 		 140 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 140 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.17 
 
 		 145 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.17 
 
 		 145 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  38.17 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.93 
 
 		 145 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  38.17 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.17 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  38.17 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  40.31 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40.31 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  40.31 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40.31 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 145 aa  88.6  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  42.31 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  42.31 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 146 aa  87.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 158 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.83 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.83 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.83 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.83 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.83 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  24.46 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  32.41 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  31.65 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  30.63 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  32.58 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.77 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  29.31 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  27.14 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  50.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 156 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  35.96 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  31.88 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>