More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0810 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  356  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  59.71 
 
 		 179 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  57.04 
 
 		 164 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 163 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  47.1 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 166 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  45.11 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  43.85 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  45.11 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  44.36 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 161 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  43.85 
 
 		 140 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 145 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 148 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  42.75 
 
 		 148 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  42.75 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  42.75 
 
 		 148 aa  98.6  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  42.75 
 
 		 148 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  44.07 
 
 		 140 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  97.8  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 146 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 144 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 150 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 146 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  37.59 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  37.59 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  37.59 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  37.59 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.67 
 
 		 146 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.67 
 
 		 146 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.67 
 
 		 146 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.67 
 
 		 146 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  41.67 
 
 		 146 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  37.59 
 
 		 145 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  37.59 
 
 		 145 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  37.59 
 
 		 145 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 148 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 144 aa  85.5  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 155 aa  84.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.53 
 
 		 155 aa  84.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  39.53 
 
 		 155 aa  84.7  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  36.09 
 
 		 140 aa  84.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  35.23 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  31.34 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  35.24 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  32.12 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 138 aa  52.4  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  34.38 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  34.4 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  33.91 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.25 
 
 		 316 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 146 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>