More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1341 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  33.82 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  32.33 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  30 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  24.63 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  30.88 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  26.73 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  26.73 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  24.3 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.11 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.11 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  23.57 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  27.36 
 
 		 195 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.5 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  23.26 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  23.66 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  21.7 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>