More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3619 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  321  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  75 
 
 		 170 aa  235  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  66.22 
 
 		 151 aa  193  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  64.86 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 151 aa  183  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  64.58 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  63.97 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  60.4 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  63.38 
 
 		 145 aa  177  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  64.18 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  60.14 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 154 aa  174  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  60.14 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  61.94 
 
 		 157 aa  172  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  59.29 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  55.48 
 
 		 153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  57.43 
 
 		 152 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  55.92 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  64.39 
 
 		 185 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 150 aa  160  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  52.32 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  51.66 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  62.31 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  51.37 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  56.38 
 
 		 152 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  52.35 
 
 		 154 aa  157  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  51.32 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  51.32 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  58.96 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  56.12 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  55.8 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 151 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  57.55 
 
 		 162 aa  153  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  54.79 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  54.79 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  52.32 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 149 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  53.38 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  56.62 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  53.52 
 
 		 147 aa  150  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  53.52 
 
 		 147 aa  150  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  56.2 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  55.47 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  55.88 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  55.88 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  55.81 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  54.93 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  55.15 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 157 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 267 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  57.48 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 168 aa  141  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  52.45 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.8 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  53.24 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  57.38 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  51.54 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>