More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2313 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  303  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 155 aa  180  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 165 aa  176  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  56.74 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 165 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  60.14 
 
 		 163 aa  174  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  56.03 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 165 aa  174  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  56.12 
 
 		 150 aa  174  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 165 aa  170  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 161 aa  168  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  59.12 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  58.52 
 
 		 152 aa  167  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 168 aa  166  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  55.81 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 151 aa  143  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.89 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  43.26 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 		 155 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  46.1 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  43.85 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  131  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  44.09 
 
 		 166 aa  131  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  47.54 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  47.54 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  46.48 
 
 		 143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  45.38 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  43.08 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  43.08 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  49.61 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  49.61 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  50.46 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 176 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  44.83 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 267 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  41.48 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 150 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 141 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 		 154 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  46.88 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  43.38 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  44.88 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  46.67 
 
 		 195 aa  123  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  48.72 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  43.51 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  43.48 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>