More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2005 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  52.55 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  50.37 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 267 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  47.48 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  54.2 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.64 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  49.65 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.48 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  53.03 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 160 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.14 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  50 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  52.59 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  46.04 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  51.03 
 
 		 165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  45.32 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  51.82 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  52.59 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  47.14 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  52.59 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.32 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.32 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  46.38 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 178 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 		 156 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  51.49 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  48.2 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  46.04 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  45.32 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  48.89 
 
 		 157 aa  123  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  47.33 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  44.37 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  49.28 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  45.19 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>