More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1966 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  296  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3865  MarR family transcriptional regulator  73.43 
 
 		 148 aa  197  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115918  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  67.83 
 
 		 170 aa  189  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  63.95 
 
 		 153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  70.29 
 
 		 157 aa  180  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 159 aa  178  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  64.49 
 
 		 159 aa  177  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  60.81 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  59.86 
 
 		 166 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 160 aa  171  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  59.44 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  57.25 
 
 		 155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  56.85 
 
 		 163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  56.2 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  53.28 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  53.57 
 
 		 152 aa  136  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  52.8 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  52.8 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  52.31 
 
 		 163 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  52.55 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  48.55 
 
 		 158 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 155 aa  129  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  55.04 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  47.33 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.13 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  41.13 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.27 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  45.52 
 
 		 157 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  49.25 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  51.13 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 158 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 158 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 165 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  46.92 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 267 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  49.64 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  46.72 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  43.38 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  44.44 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 185 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 178 aa  120  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  47.54 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  51.82 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  46.92 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>