More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0960 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  285  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  67.83 
 
 
146 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  67.83 
 
 
146 aa  190  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  67.83 
 
 
146 aa  190  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
149 aa  173  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  63.24 
 
 
146 aa  169  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  65.93 
 
 
144 aa  169  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  61.31 
 
 
144 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 
149 aa  164  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  63.08 
 
 
170 aa  159  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  62.31 
 
 
162 aa  157  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  59.57 
 
 
155 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
149 aa  154  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  56.93 
 
 
147 aa  153  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  56.34 
 
 
158 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  68.38 
 
 
143 aa  150  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  55.8 
 
 
151 aa  149  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  60.77 
 
 
149 aa  148  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 
153 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  59.56 
 
 
151 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 
153 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
185 aa  147  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  58.14 
 
 
145 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  53.96 
 
 
158 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 
165 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  58.02 
 
 
160 aa  147  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  53.9 
 
 
166 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  55.8 
 
 
178 aa  146  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  56.35 
 
 
157 aa  146  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  55.56 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  56.49 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  57.86 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  58.82 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  51.77 
 
 
166 aa  144  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  53.28 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  61.11 
 
 
144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  54.62 
 
 
154 aa  144  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  52.21 
 
 
151 aa  143  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  49.28 
 
 
150 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 
151 aa  143  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  54.41 
 
 
146 aa  143  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  49.28 
 
 
150 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
152 aa  143  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.28 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.28 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 
165 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
150 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
150 aa  143  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  57.45 
 
 
153 aa  143  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  52.9 
 
 
147 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 
165 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  49.28 
 
 
150 aa  142  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  54.07 
 
 
149 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 
150 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  52.9 
 
 
147 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  53.62 
 
 
152 aa  141  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  57.04 
 
 
155 aa  141  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  56.35 
 
 
163 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
150 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  58.2 
 
 
150 aa  141  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  56.3 
 
 
156 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
150 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
150 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 
150 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  53.33 
 
 
162 aa  140  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  52.55 
 
 
165 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  55.38 
 
 
151 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  49.29 
 
 
154 aa  140  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  57.25 
 
 
147 aa  140  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  52.48 
 
 
150 aa  140  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  55.38 
 
 
167 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  54.01 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  57.38 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
168 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  53.62 
 
 
195 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  54.62 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  53.24 
 
 
161 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  55.04 
 
 
156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  52.24 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  55.38 
 
 
159 aa  138  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  56.69 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  55.88 
 
 
158 aa  137  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
151 aa  138  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  50 
 
 
154 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 
156 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  51.94 
 
 
158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  54.07 
 
 
161 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  52.76 
 
 
143 aa  137  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  55.91 
 
 
150 aa  136  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  50.72 
 
 
152 aa  136  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 
148 aa  135  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  51.82 
 
 
157 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  53.73 
 
 
141 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>