More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0969 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 171 aa  342  1e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  59.31 
 
 		 152 aa  180  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  49.28 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 143 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  53.54 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  45.7 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  50.41 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  46.97 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  48.78 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 145 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 148 aa  121  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  47.66 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  45.53 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  46.28 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  46.28 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  46.28 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  46.21 
 
 		 150 aa  117  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 		 153 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  43.88 
 
 		 147 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  38.71 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  42.65 
 
 		 195 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  47.9 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  44.36 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 143 aa  114  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  41.29 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  44.12 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.55 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  43.2 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 149 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  43.2 
 
 		 149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 152 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  37.59 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0865  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  39.29 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>