More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3980 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  303  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 152 aa  203  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  53.85 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  45.33 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  50.67 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 168 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  47.92 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.66 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.39 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  46.9 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 267 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  51.8 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  53.38 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  44.22 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  46.43 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  51.94 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  52.21 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  49.29 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.94 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  47.95 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  51.66 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  51.08 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  51.08 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  51.08 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  48.97 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  58.62 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  48.63 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  57.76 
 
 		 178 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  45.52 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  48.61 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  45.52 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>