More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1189 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  57.53 
 
 		 159 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  57.53 
 
 		 158 aa  169  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  58.82 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  60.71 
 
 		 152 aa  160  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  58.39 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  56.12 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 145 aa  153  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 151 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  57.66 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  55.47 
 
 		 153 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  54.48 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  55.97 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  55.22 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  53.79 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  55.8 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  53.19 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  55.15 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  53.24 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  55.07 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  51.01 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  54.74 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  51.77 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  57.35 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 149 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 267 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  51.06 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  53.68 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  54.74 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  54.55 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 144 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  54.55 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  53.96 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  53.96 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  47.86 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 144 aa  140  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 178 aa  140  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  54.35 
 
 		 146 aa  140  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 		 162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  51.85 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  52.94 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  52.86 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  49.63 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  48.18 
 
 		 150 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  52.21 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.18 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.18 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  52.9 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  48.18 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  52.21 
 
 		 195 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  54.2 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>