More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1176 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  99.32 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  67.83 
 
 		 146 aa  190  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  65.97 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  57.04 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  60.14 
 
 		 157 aa  150  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  55.88 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  55.15 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  55.88 
 
 		 162 aa  147  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  52.52 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  56.72 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  61.26 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  58.73 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  54.55 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  50.69 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  51.77 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  51.77 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  52.67 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  55.04 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  60.33 
 
 		 147 aa  139  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 151 aa  139  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  53.68 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  51.77 
 
 		 195 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  52.99 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  57.14 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  52.9 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  55.64 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  48.87 
 
 		 159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  52.21 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  63.3 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  51.82 
 
 		 167 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 144 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  51.82 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  53.73 
 
 		 147 aa  131  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  55.3 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  51.43 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  50 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  51.59 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 156 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  52.38 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.49 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  50.79 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  47.45 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  52.38 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.45 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.45 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  47.45 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 147 aa  129  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.59 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  49.62 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  47.41 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>