More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2661 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  289  7e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  59.86 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  55.94 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  53.9 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  51.8 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.8 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.1 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.1 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  47.1 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  47.1 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  49.26 
 
 		 165 aa  141  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 165 aa  141  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 165 aa  140  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  57.26 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 165 aa  139  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  49.63 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 178 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  45.11 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  47.01 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  49.12 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  45.04 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  52.68 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  48.76 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 158 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  47.41 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  44.12 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  50.43 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.71 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  49.57 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  46.92 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 151 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  50.93 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  44.27 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  45.93 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  45.93 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  39.85 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  48.67 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  49.55 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 151 aa  121  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  47.79 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  50.89 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  43.51 
 
 		 167 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  46.9 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.65 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  41.6 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  41.6 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  41.6 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 151 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  44.72 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  43.75 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  45.13 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  48.74 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  40.88 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  44.25 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>