More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3415 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
149 aa  296  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  90.28 
 
 
144 aa  259  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
146 aa  173  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  64.44 
 
 
146 aa  167  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  59.86 
 
 
144 aa  164  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  61.07 
 
 
147 aa  160  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  56.94 
 
 
146 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  56.94 
 
 
146 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  56.94 
 
 
146 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  53.42 
 
 
162 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  58.87 
 
 
141 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 
149 aa  147  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  53.96 
 
 
185 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  56.03 
 
 
170 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  52.35 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  52.14 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  49.24 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  49.24 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
152 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  55.64 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  51.01 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  54.89 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 
153 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  61.26 
 
 
143 aa  133  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
165 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  50.69 
 
 
149 aa  133  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 
152 aa  133  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
165 aa  130  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
166 aa  130  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 
147 aa  130  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  47.89 
 
 
152 aa  130  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
153 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
165 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  46.9 
 
 
166 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 
158 aa  129  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
151 aa  129  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  49.29 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  52.63 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  53.96 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  50.72 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  51.56 
 
 
151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  48.46 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 
163 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 
159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
165 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  54.1 
 
 
150 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  48.18 
 
 
143 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  46.26 
 
 
168 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  46.98 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  46.98 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  58.47 
 
 
155 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  44.97 
 
 
150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.77 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  43.45 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  47.18 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  57.39 
 
 
178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  44.22 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 
170 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  51.43 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 
150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  47.18 
 
 
165 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  54.1 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.83 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.83 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  48.94 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  55.17 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  49.24 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 
150 aa  124  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  46.9 
 
 
156 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  59.82 
 
 
151 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
147 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  54.33 
 
 
149 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  45.32 
 
 
156 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  50.72 
 
 
153 aa  124  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 
157 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  47.45 
 
 
149 aa  123  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
161 aa  123  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
151 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 
159 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
163 aa  123  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
150 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
150 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  47.55 
 
 
176 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  52.9 
 
 
157 aa  123  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  50.38 
 
 
156 aa  123  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
160 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  52.24 
 
 
153 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>