More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3331 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  317  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  64.96 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  59.87 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 147 aa  180  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  61.22 
 
 		 152 aa  178  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  63.97 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 165 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 165 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  57.93 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  56 
 
 		 165 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  56 
 
 		 165 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 168 aa  173  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  61.07 
 
 		 161 aa  168  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  56.38 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  58.78 
 
 		 144 aa  164  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  60.31 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  52.24 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  50.75 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  47.4 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  51.54 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  52.08 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  52.17 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 149 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  52.59 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  46.32 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  45.59 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  51.85 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  47.68 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  51.45 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  49.25 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  48.95 
 
 		 171 aa  137  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  51.16 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 178 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 196 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  46.97 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 191 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  46.97 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.23 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  46.97 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  49.25 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 150 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  46.9 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  49.25 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  44.22 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  48.92 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  48.23 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 143 aa  130  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  50 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  46.62 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  45.77 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  49.26 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  46.03 
 
 		 166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>