More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02614 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  100 
 
 
153 aa  312  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  74.51 
 
 
153 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  73.86 
 
 
153 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  59.59 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  56.77 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  63.57 
 
 
150 aa  169  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  59.44 
 
 
151 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  55.77 
 
 
157 aa  168  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  59.42 
 
 
154 aa  166  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  56.85 
 
 
151 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  58.7 
 
 
151 aa  164  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  55.48 
 
 
162 aa  164  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 
162 aa  161  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  56.93 
 
 
149 aa  160  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  57.05 
 
 
152 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  58.28 
 
 
152 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0896  transcriptional regulator, MarR family  64.58 
 
 
156 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  53.79 
 
 
156 aa  157  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  55.56 
 
 
149 aa  156  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  56.43 
 
 
153 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 
155 aa  154  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  53.38 
 
 
170 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  55.4 
 
 
162 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  55.47 
 
 
158 aa  150  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
185 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  55.88 
 
 
145 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  56.43 
 
 
151 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  53.1 
 
 
154 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  55.71 
 
 
151 aa  146  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  48.99 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  48.99 
 
 
157 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  51.37 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4591  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
182 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  50.68 
 
 
151 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
151 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
166 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  50.72 
 
 
161 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
159 aa  141  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
151 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
267 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  48.23 
 
 
166 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 
158 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 
158 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  53.9 
 
 
150 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 
151 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
152 aa  137  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  56.2 
 
 
151 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
157 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 
150 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  51.33 
 
 
156 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 
150 aa  135  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  50.76 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  46.26 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  52.94 
 
 
158 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  47.79 
 
 
156 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  52.45 
 
 
176 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.12 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.12 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  52.86 
 
 
146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  47.79 
 
 
156 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 
150 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 
150 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 
150 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
150 aa  133  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  50.76 
 
 
154 aa  133  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  50.76 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  49.24 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  50.72 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  52.59 
 
 
167 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
153 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 
158 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  49.59 
 
 
148 aa  130  7.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  47.26 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  50.72 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  49.29 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  51.56 
 
 
164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  56.03 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 
168 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
165 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>