More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2845 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
145 aa  293  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  88.11 
 
 
145 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  59.57 
 
 
171 aa  176  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  56.52 
 
 
161 aa  167  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  56.03 
 
 
166 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  53.9 
 
 
157 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 
151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  51.77 
 
 
157 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  54.61 
 
 
152 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  54.93 
 
 
153 aa  159  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
151 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 
151 aa  158  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  53.57 
 
 
166 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  56.82 
 
 
185 aa  157  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
153 aa  156  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  53.24 
 
 
151 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 
156 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  57.97 
 
 
170 aa  153  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 
151 aa  153  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  50.71 
 
 
153 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 
153 aa  150  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  53.52 
 
 
155 aa  150  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  51.8 
 
 
151 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
145 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  53.57 
 
 
162 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 
151 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
156 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 
151 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 
151 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 
151 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 
151 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 
156 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  47.18 
 
 
143 aa  146  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  50 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
151 aa  144  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
160 aa  144  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 
157 aa  143  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
154 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
154 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
151 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 
150 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 
150 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
155 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
150 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 
150 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 
150 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  48.59 
 
 
170 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  49.63 
 
 
162 aa  140  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  54.26 
 
 
165 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  54.26 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  54.26 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  54.26 
 
 
165 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  50.36 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  58.18 
 
 
158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  50.37 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
150 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.92 
 
 
162 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  50.79 
 
 
149 aa  136  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  50.37 
 
 
157 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  49.63 
 
 
149 aa  135  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 
150 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.89 
 
 
152 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
176 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
149 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 
165 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 
144 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  51.45 
 
 
168 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 
156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  53.54 
 
 
168 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  48.2 
 
 
167 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 
153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  58.18 
 
 
157 aa  134  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  47.48 
 
 
150 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 
153 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
158 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
150 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
150 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
158 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
150 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
150 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  52.76 
 
 
165 aa  133  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  53.66 
 
 
150 aa  133  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
267 aa  133  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  47.1 
 
 
152 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  48.89 
 
 
143 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 
150 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  48.87 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  48.74 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  48.74 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 
150 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  55.45 
 
 
150 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 
165 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>